魔術師與英靈為奪取能如愿所償的愿望機“圣杯”而展開圣杯戰爭。日本的第五次圣杯戰爭結束后的幾年,在美國西部的城市雪原市被觀測到有新的圣杯戰爭預兆,集結的魔術師與英靈……缺失的職階,無法被選中的英靈,暗中涌動的國家,為戰斗造起來的城市。