寬永十五年，德川幕府打壓天主教徒，導致爆發血腥殘酷的島原之亂。在這起事件中，約有兩萬名天主教徒慘遭殺害。及至深夜，滿懷巨大仇恨的教眾首領天草四郎時貞（沢田研二 飾）復活，他捐棄信仰，轉生魔界，發誓報復幕府統治者。在此之后，他接連將細川夫人（佳那晃子 飾）的怨靈、瀕臨壽終卻心存遺憾的宮本武藏（緒形拳 飾）以及寶藏院胤舜（室田日出男 飾）、遭遇滅族的伊賀忍者霧丸（真田広之 飾）拉入魔界，邪魔的力量陡然倍增。細川化身阿玉迷惑四代將軍家綱（松橋登 飾），柳生但馬守宗矩（若山富三郎 飾）有心除魔，無奈天不假年，更在彌留之際墮入魔道。柳生十兵衛（千葉真一 飾）成為鏟除邪魔外道的最后希望……